显示一个!
你知道这是神马分析吗? RDA分析?
不! ! ! 其实这是一个CCA分析!
各位童鞋是不是已经哭倒在地上了呢? ! 本期小编就和大家聊一聊RDA分析的“孪生兄弟”CCA分析。 他们为什么被称为“孪生兄弟”? 请听小编一一道来!
CCA分析也叫canonical correspondence analysis,它还有个帅气的英文名字叫Canonical Correspondence Analysis!
与RDA分析一样,CCA分析也是一种限制排序,用于分析物种组成与环境因素之间的关系。
它们的图形解释是相同的。 如图1,箭头代表不同的环境因素,射线越长信息分析,环境因素的影响越大。 环境因素之间的夹角代表了环境因素的时间关系。 当为锐角时,表示两个环境因素之间存在正相关关系,当为钝角时,则表示负相关关系。
它们可以用相同的软件制作,比如CANOCO,R语言的Vegan包。
但它们之间也有区别,CCA是基于单峰模型的,而RDA是基于线性模型的。 见图 2
分析时,什么时候用CCA分析,什么时候用RDA分析?
使用CANOCO分析数据时,需要先对物种数据进行DCA分析信息分析,然后根据DCA的分析结果选择CCA分析或RDA分析。 以图3-CANOCO分析结果为例。
对于Lengths of gradient,如果四个轴中最大梯度的值大于4,则选择CCA分析更为合适; 如果该值在3.0-4.0之间,则可以同时选择RDA分析和CCA分析; 如果小于3.0,则RDA分析的结果优于CCA分析。
你觉得很振奋吗?
事实上,在维集生物的生物信息服务中,我们可以帮您进行RDA、CCA、PCA、PCoA等的分析!